##### Model ################ # TITLE:Heat Shock Response No.13 # INFO:Model of HSP13 # CONVERSION TYPE # GENE-PROTEIN:CMA # METABOLIC:NONE N_VAR ; 24; # num of variables(all) N_ALGEBR; 0; # num of variables(Algebraic Eq) #Y_START ; index; initial_value; tag #comment Y_START ; 1; 5.409438e-010; s70.cyt # Y_START ; 2; 2.947924e-010; RNAP.cyt # Y_START ; 3; 5.318506e-011; s32.cyt # Y_START ; 4; 9.898634e-007; FtsH.cyt # Y_START ; 5; 9.551670e-007; DnaK.cyt # Y_START ; 6; 3.024632e-005; Protein.cyt # Y_START ; 7; 5.024628e-003; Protein-f.cyt # Y_START ; 8; 8.766302e-006; Enhancer(s32).cyt # Y_START ; 9; 7.502398e-008; Enhancer(HSP).cyt # Y_START ; 10; 1.393774e-008; mRNA(s32).cyt # Y_START ; 11; 3.919220e-008; mRNA(DnaK).cyt # Y_START ; 12; 1.567713e-009; mRNA(FtsH).cyt # Y_START ; 13; 7.620000e-006; mRNA(Protein).cyt # Y_START ; 14; 1.589913e-010; s70:RNAP.cyt # Y_START ; 15; 1.393774e-006; Enhancer(s32):s70:RNAP.cyt # Y_START ; 16; 1.567256e-011; RNAP:s32.cyt # Y_START ; 17; 1.175791e-009; 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3; 1e+14;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_RNAP.cyt_s32.cyt # PARAM ;ka ; 4; 1e+14;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_Enhancer(HSP).cyt_RNAP:s32.cyt # PARAM ;ka ; 5; 1e+12;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_DnaK.cyt_s32.cyt # PARAM ;ka ; 6; 1e+13;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_FtsH.cyt_s32.cyt # PARAM ;ka ; 7; 1e+11;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_DnaK.cyt_Protein.cyt # PARAM ;ka ; 8; 1e+10;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_D.cyt_s70:RNAP.cyt # PARAM ;ka ; 9; 1e+10;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_D.cyt_RNAP:s32.cyt # PARAM ;ka ; 10; 1e+11;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_D.cyt_RNAP.cyt # PARAM ;ka ; 11; 1e+13;;0;D;;;; binding_association_rate_constant_FtsH.cyt_s32:DnaK.cyt # PARAM ;kd ; 1; 1E+5;;0;D;;;; dissociation_rate_constant_RNAP.cyt_s70.cyt # PARAM ;kd ; 2; 1E+5;;0;D;;;; dissociation_rate_constant_Enhancer(s32).cyt_s70:RNAP.cyt # PARAM ;kd ; 3; 1E+5;;0;D;;;; dissociation_rate_constant_RNAP.cyt_s32.cyt # PARAM ;kd ; 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3; 20;;0;D;;;; translation_rate_constant_mRNA(DnaK).cyt # PARAM ;kp ; 4; 20;;0;D;;;; translation_rate_constant_mRNA(Protein).cyt # PARAM ;kpd ; 1; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_s32.cyt # PARAM ;kpd ; 2; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_FtsH.cyt # PARAM ;kpd ; 3; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_DnaK.cyt # PARAM ;kpd ; 4; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_Protein.cyt # PARAM ;kpd ; 5; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_Protein-f.cyt # PARAM ;kpd ; 6; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_s70:RNAP.cyt # PARAM ;kpd ; 7; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_Enhancer(s32):s70:RNAP.cyt # PARAM ;kpd ; 8; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_RNAP:s32.cyt # PARAM ;kpd ; 9; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_Enhancer(HSP):RNAP:s32.cyt # PARAM ;kpd ; 10; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_s32:DnaK.cyt # PARAM ;kpd ; 11; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_s32:FtsH.cyt # PARAM ;kpd ; 12; 0.03;;0;D;;;; decomposition_rate_constant_Protein:DnaK.cyt # PARAM ;kpd ; 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